Třetí film Men in Black je pokračováním slavné americké komedie. Obsazení jsou stejné Tommy Lee Jones a Will Smith. Práce režiséra opět převzal Barry Sonnenfeld, výkonný producent Stevena Spielberga. V kinech se film začal 23. května 2012.
Tentokrát roli negativního hrdiny převzal Jamain Clement, hraje Borise. Toto je zločinec, který utekl z Lunární vězení. Hoří nenávistí vůči agentovi Kayovi, který v červenci 1969 chytil zločince a nechal ho bez ruky. Když Kay najednou zjistí, že Boris běžel, lituje, že ho během zatčení nezabil. Poté agent jednoduše zmizí a že si jen Jane pamatuje, že existoval. Ostatní zaměstnanci v černém si myslí, že Kay zemřel při střetu s nějakým zločincem v roce 1969.
Jediným vysvětlením tohoto otřesu reality je změna v minulosti. Jay a agent O se rozhodli, že se na tom podílel Boris. Potvrzení tohoto je další událostí kosmického měřítka - invaze rasy Borise na Zemi. V předchozí realitě to nebylo možné, protože Kay nainstaloval na planetě ochranné zařízení zvané „ArcNet“. Nyní, v souvislosti se smrtí agenta před několika desítkami let, Země neměla žádný screening před vesmírnými nepřáteli.
Jay zjistí, že Boris poslal do minulosti Jeffrey Price, obchodník s elektronikou, který měl ve svém arzenálu nelegální časový posun. Agent nemá na výběr, ale vrátit se včas, aby zachránil svého partnera. A hned ho mladý Kay zatkne. Během výslechu mu Jay řekne všechno a budoucí partner věří. Společně najdou Arcanian Griffin, který má ArkNet. Nyní všichni tři pokračují v cestě a vydali se na ochranu měsíce. Ale na raketě jsou zatčeni plukovníkem. Nyní se stává strážcem tajemství Jaye.
Od této chvíle dochází k rychlému vývoji událostí. Hrdinové se setkávají se dvěma Borisy a dochází k boji. Zločin z budoucnosti je vržen do raketového dolu a mladý Boris jde také za ním. Je nainstalována ochrana země. A teď by se zdálo, že Jayova mise byla dokončena, ale objeví se zázračný přežívající mladý zločinec. Plukovník umírá, ale Borisovi se podaří zničit. A ve filmu se objeví nová postava. Chlapec vystoupí z plukovníka a začne hledat svého otce. Agent se uznává. Jay se vrací v pravý čas a potkává Kay v kavárně. Všechno se vrátilo.